Резюме
Кишечник і легені анатомічно різні, але потенційні анатомічні комунікації та складні шляхи взаємодії, що включають мікробіоту, зумовили існування осі кишечник-легені (gut–lung axis, GLA). Все більше доказів свідчить про ключову роль перехресних взаємодій між екосистемами у підтримці гомеостазу господаря та в еволюції захворювання. GLA може забезпечувати імунні реакції та перешкоджати розвитку респіраторних захворювань.
Останні дослідження мікробіоти призвели до покращення знань про спільноти коменсальних мікроорганізмів у людському тілі. Поверхня шкіри та слизових оболонок людини пов’язана зі складними екосистемами (мікробіотою), що складаються з бактерій (бактеріобіота), грибів (мікобіота), вірусів (віробіота), фагів тощо1. Роль кишкової бактеріобіоти у місцевому гомеостазі та захворюваннях все більше досліджується, але її віддалений вплив потребує подальшого вивчення2. Серед відповідних міжорганних зв’язків вісь кишечник-легені (gut–lung axis, GLA) залишається менш вивченою, ніж вісь кишечник-мозок (gut–brain axis). Однак не слід забувати про розуміння участі мікобіоти у здоров’ї людини та міжорганних зв’язках3.
Мікробіота легенів
Мікробіота легенів являє собою значно меншу біомасу, ніж мікрофлора кишечника: приблизно від 10 до 100 бактерій на 1000 клітин людини.
Її склад залежить від мікробної колонізації ротоглотки та верхніх дихальних шляхів, від елімінаційних можливостей господаря (мукоциліарний кліренс), від взаємодій імунної системи господаря та від місцевих умов проліферації мікробів, таких як як рН або концентрацію кисню5.
Переважаючі бактеріальні види в легенях такі ж, як і в кишечнику – Firmicutes та Bacteroidetes, за ними – Proteobacteria та Actinobacteria6. У здорових суб’єктів основними ідентифікованими грибами зазвичай є Ascomycota (аспергіллус, кладоспорій, еремотецій та вандервалтозима) та Microsporidia (Systenostrema)7. На відміну від мікрофлори кишечника або ротової порожнини, дані, що підкреслюють взаємодію між бактеріями та грибами в дихальних шляхах людини, є більш розсіяними8. Однак дані досліджень in vitro та in vivo свідчать про відповідні перехресні взаємодії між царствами бактерій і грибів8. Цей діалог може включати декілька шляхів, таких як фізична взаємодія, виробництво антимікробних агентів, модуляція імунної відповіді та обмін поживними речовинами9.
Між Candida та Streptococcus були задокументовані синергічні взаємодії, такі як стимуляція росту Streptococcus за участю Candida, збільшення утворення біоплівки або посилення патогенності Candida за допомогою Streptococcus10.
Дослідження in vitro показали посилений ріст Aspergillus fumigatus у присутності синьогнійної палички через здатність цвілі засвоювати летючі сполуки сірки, отримані з Pseudomonas aeruginosa11. Однак модуляція мікробіоти легень не обмежується місцевими перехресними взаємодіями, а також залежить від перехресних взаємодій між кишечником та легенями.
Кореляція між складом мікрофлори кишечника та легенів
Від народження і протягом усього життя існує тісна кореляція між складом мікрофлори кишечника та легенів, що свідчить про тісну взаємодію їхніх екосистем (рисунок 1)12.
Наприклад, зміна раціону новонароджених впливає на склад їх мікробіоти легенів, а трансплантація фекалій у щурів викликає зміни мікробіоти легенів [13].
Бактеріобіота, мікобіота та віробіота тісно взаємодіють усередині кожного органу за допомогою прямих або непрямих механізмів, що доповнюють один одного (рис. 1). Мікробіота кишечника впливає як на імунну систему кишечника, так і на імунну систему легенів через локальні або віддалені взаємодії, які включають або CD8+ Т-клітини, Th17, інтерлейкіни IL-25, IL-13, простагландин E2 та/або NF-κB-залежні шляхи.
Мікробіота легенів впливає на імунітет слизових оболонок і сприяє імунній толерантності шляхом залучення нейтрофілів, продукування протизапальних цитокінів, опосередкованих рецептором 2 (TLR2), і вивільнення антимікробних пептидів, таких як β-дефензин 2, стимульований Th17. З іншого боку, мікробіом легенів також впливає на імунну систему кишечника.
Стан здоров’я господаря також може вплинути на цю взаємодію між кишечником і легенями. У новонароджених із муковісцидозом колонізація кишечника Roseburia, Dorea, Coprococcus, Blautia або Escherichia передбачає їхню появу в дихальних шляхах, а їх кількість у кишечнику та легенях з часом сильно корелює [15].
І навпаки, мікробіота легенів може впливати на склад мікробіоти кишечника. У доклінічній моделі грипозна інфекція викликає збільшення частки ентеробактерій та зменшення кількості лактобактерій та лактококів у кишечнику. Постійне введення ліпополісахаридів в легені мишей асоціюється з порушеннями мікрофлори кишечника4.
Хоча інгаляції гастроезофагеального вмісту та ковтання мокротиння частково пояснюють цей міжорганний зв’язок, GLA також включає непрямі комунікації, такі як імунна модуляція.
Мікробіота кишечника та місцевий імунітет
Вплив мікробіоти кишечника на місцеву імунну систему був вже детально розглянутий16.
Мікробіота кишечника тісно взаємодіє з імунною системою слизової, використовуючи як запальні, так і регуляторні сигнали [17]. Вона також впливає на реакцію нейтрофілів, модулюючи їх здатність до екстравазації з крові.
Сигналізація Toll-подібних рецепторів (TLR) необхідна для мієлопоезу, керованого мікроорганізмами, і здійснює неонатальний відбір, що формує мікробіоту кишечника з довготерміновми наслідками18. Крім того, мікрофлора кишечника спілкується з імунними клітинами, що експресують TLR або GPR41/43, і впливає на них за допомогою мікробно-асоційованих молекулярних структур або коротколанцюгових жирних кислот (КЛЖК)19. Схоже, коменсальні гриби посилюють захисні властивості бактерій як на місцевому, так і на системному рівні, при цьому особливу роль відіграє компонент стінки гриба. Крім того, гриби здатні продукувати КЛЖК20.
Мікробіота легенів та місцевий імунітет
Дані щодо значення мікробіоти легенів у дозріванні та гомеостазі легеневого імунітету з’явилася протягом останніх років. Колонізація дихальних шляхів забезпечує значні сигнали для дозрівання місцевих імунних клітин з довготерміновими наслідками.
Доклінічні дослідження підтверджують причинно-наслідковий зв’язок між колонізацією дихальних шляхів та регуляцією та дозріванням імунних клітин дихальних шляхів.
Миші без мікробів демонструють підвищену локальну продукцію цитокінів та IgE, пов’язаних з Th2, що сприяє алергічному запаленню дихальних шляхів21. Відповідно вплив на легені коменсальних бактерій зменшує вироблення Th2-цитокінів після контакту з алергеном та індукує регуляторні клітини22. Створення резистентних В -клітин пам’яті в легенях також вимагає зустрічі з місцевими антигенами мікробіоти легенів, особливо це стосується імунітету проти вірусів, зокрема таких як грип23.
Імунна модуляція у межах осі «кишечник-легені»
Окрім місцевої імунної регуляції за допомогою специфічної мікробіоти, зараз визнається тривалий імунний вплив мікробіоти кишечника, особливо на імунну систему легенів2.
Мезентеріальна лімфатична система – це важливий шлях комунікації між легенями та кишечником, через який неушкоджені бактерії, їх фрагменти або метаболіти (наприклад, КЛЖК) можуть переміщуватися через кишковий бар’єр, досягати системного кровообігу та модулювати імунну відповідь легенів.
КЛЖК в основному утворюються шляхом ферментації харчових волокон бактеріями, особливо якщо дієта з високим вмістом клітковини. КЛЖК діють у легенях як сигнальні молекули на резидентних антиген-презентуючих клітинах, що послаблюють запальні та алергічні реакції24. Миші з дефіцитом рецепторів КЛЖК демонструють підвищену запальну реакцію в експериментальних моделях астми. Гриби, включно з A. fumigatus, також можуть виробляти КЛЖК або створювати біоплівку, що посилює бактеріальну продукцію КЛЖК, але з іншого боку, бактеріальні КЛЖК можуть гальмувати ріст грибів25.
Іншими важливими гравцями цього віддаленого імунного ефекту є кишкові сегментовані ниткоподібні бактерії (SFB) – коменсальні бактерії, що колонізують клубову кишку більшості тварин, включно з людьми, і беруть участь у модуляції розвитку імунної системи.
SFB регулюють поляризацію CD4+ Т-клітин, що беруть участь у реакції на легеневі грибкові інфекції та аутоімунні прояви з боку легенів26. Нещодавно було показано, що вроджені лімфоїдні клітини, які беруть участь у відновленні тканин, залучаються з кишечника до легенів у відповідь на запальні сигнали через IL-2527. Нарешті, активація кишкового TLR, необхідна для NF-κB-залежних шляхів вродженого імунітету та запалення, і асоціюється із посиленням протигрипозної відповіді легенів у мишей28
Інші механізми можуть бути залучені до модуляції довготривалої імунної відповіді, пов’язані з мікробіотою кишечника, що підтверджується збільшенням кількості мононуклеарних лейкоцитів та підвищенням фагоцитарної та літичної активності після лікування пробіотиками Bifidobacterium lactis HN01929.
Дієта, особливо споживання клітковини, яка підвищує системний рівень КЛЖК, та пробіотики впливають на імунну відповідь легенів і на перебіг респіраторних захворювань [30].
Імунний діалог GLA залишається двостороннім процесом. Наприклад, носова інокуляція Salmonella сприяє імунізації кишечника від сальмонели, що залежить від дендритних клітин легенів31. Грип також модулює склад мікробіоти кишечника. Ці кишкові мікробні порушення не пов’язані з кишковим тропізмом вірусу грипу, але опосередковані клітинами Th1732.
Підводячи підсумок, GLA є результатом складної взаємодії між різними мікробними компонентами мікрофлори кишечника та легенів у поєднанні з місцевими та віддаленими імунними ефектами. Усі ці взаємодії свідчать про важливу роль GLA у розвитку захворювань дихальних шляхів.
Література:
- 1. Cho, I., and Blaser, M. J. (2012). The human microbiome: at the interface of health and disease. Nat. Rev. Genet. 13, 260–270. doi: 10.1038/nrg3182.
- 2. Chiu, L., Bazin, T., Truchetet, M.-E., Schaeverbeke, T., Delhaes, L., and Pradeu, T. (2017). Protective microbiota: from localized to long-reaching co-immunity. Front. Immunol. 8:1678. doi: 10.3389/fimmu.2017.01678
- 3. Enaud, R., Vandenborght, L.-E., Coron, N., Bazin, T., Prevel, R., Schaeverbeke, T., et al. (2018). The mycobiome: a neglected component in the microbiota-gut-brain axis. Microorganisms 6:E22. doi: 10.3390/microorganisms6010022
- 4. Sze, M. A., Dimitriu, P. A., Hayashi, S., Elliott, W. M., McDonough, J. E., Gosselink, J. V., et al. (2012). The lung tissue microbiome in chronic obstructive pulmonary disease. Am. J. Respir. Crit. Care. Med. 185, 1073–1080. doi: 10.1164/rccm.201111-2075OC
- 5. Wilson, M. T., and Hamilos, D. L. (2014). The nasal and sinus microbiome in health and disease. Curr. Allergy Asthma Rep. 14:485. doi: 10.1007/s11882-014-0485-x
- 6. Charlson, E. S., Bittinger, K., Haas, A. R., Fitzgerald, A. S., Frank, I., Yadav, A., et al. (2011). Topographical continuity of bacterial populations in the healthy human respiratory tract. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 184, 957–963. doi: 10.1164/rccm.201104-0655OC
- 7. Vandenborght, L.-E., Enaud, R., Coron, N., Denning, D. W., and Delhaes, L. (2019). “From culturomics to metagenomics: the mycobiome in chronic respiratory diseases,” in The Lung Microbiome (Norwich: European Respiratory Society), 88–118. doi: 10.1183/2312508X.10015918
- 8. Soret, P., Vandenborght, L.-E., Francis, F., Coron, N., Enaud, R., The Mucofong Investigation Group, et al. (2019). Respiratory mycobiome and suggestion of inter-kingdom network during acute pulmonary exacerbation in cystic fibrosis. Sci. Rep. doi: 10.1038/s41598-020-60015-4. [Epub ahead of print].
- 9. Peleg, A. Y., Hogan, D. A., and Mylonakis, E. (2010). Medically important bacterial-fungal interactions. Nat. Rev. Microbiol. 8, 340–349. doi: 10.1038/nrmicro2313
- 10. Xu, H., Sobue, T., Thompson, A., Xie, Z., Poon, K., Ricker, A., et al. (2014). Streptococcal co-infection augments Candida pathogenicity by amplifying the mucosal inflammatory response. Cell. Microbiol. 16, 214–231. doi: 10.1111/cmi.12216
- 11. Scott, J., Sueiro-Olivares, M., Ahmed, W., Heddergott, C., Zhao, C., Thomas, R., et al. (2019). Pseudomonas aeruginosa-derived volatile sulfur compounds promote distal Aspergillus fumigatus growth and a synergistic pathogen-pathogen interaction that increases pathogenicity in co-infection. Front. Microbiol. 10:2311. doi: 10.3389/fmicb.2019.02311
- 12. Grier, A., McDavid, A., Wang, B., Qiu, X., Java, J., Bandyopadhyay, S., et al. (2018). Neonatal gut and respiratory microbiota: coordinated development through time and space. Microbiome 6:193. doi: 10.1186/s40168-018-0566-5
- 13. Liu, T., Yang, Z., Zhang, X., Han, N., Yuan, J., and Cheng, Y. (2017). 16S rDNA analysis of the effect of fecal microbiota transplantation on pulmonary and intestinal flora. 3 Biotech 7:370. doi: 10.1007/s13205-017-0997-x
- 14. Raphaël Enaud, Renaud Prevel, Eleonora Ciarlo, Fabien Beaufils, Gregoire Wieërs, Benoit Guery and Laurence Delhaes.The Gut-Lung Axis in Health and Respiratory Diseases: A Place for Inter-Organ and Inter-Kingdom CrosstalksFront. Cell. Infect. Microbiol., 19 February 2020 | https://doi.org/10.3389/fcimb.2020.00009
- 15. Madan, J. C., Koestler, D. C., Stanton, B. A., Davidson, L., Moulton, L. A., Housman, M. L., et al. (2012). Serial analysis of the gut and respiratory microbiome in cystic fibrosis in infancy: interaction between intestinal and respiratory tracts and impact of nutritional exposures. MBio 3, e00251–12. doi: 10.1128/mBio.00251-12
- 16. Elson, C. O., and Alexander, K. L. (2015). Host-microbiota interactions in the intestine. Dig. Dis. 33, 131–136. doi: 10.1159/000369534
- 17. Skelly, A. N., Sato, Y., Kearney, S., and Honda, K. (2019). Mining the microbiota for microbial and metabolite-based immunotherapies. Nat. Rev. Immunol. 19, 305–323. doi: 10.1038/s41577-019-0144-5
- 18. Fulde, M., Sommer, F., Chassaing, B., van Vorst, K., Dupont, A., Hensel, M., et al. (2018). Neonatal selection by toll-like receptor 5 influences long-term gut microbiota composition. Nature 560, 489–493. doi: 10.1038/s41586-018-0395-5
- 19. Le Poul, E., Loison, C., Struyf, S., Springael, J.-Y., Lannoy, V., Decobecq, M.-E., et al. (2003). Functional characterization of human receptors for short chain fatty acids and their role in polymorphonuclear cell activation. J. Biol. Chem. 278, 25481–25489. doi: 10.1074/jbc.M301403200
- 20. Xiros, C., Shahab, R. L., and Studer, M. H.-P. (2019). A cellulolytic fungal biofilm enhances the consolidated bioconversion of cellulose to short chain fatty acids by the rumen microbiome. Appl. Microbiol. Biotechnol. 103, 3355–3365. doi: 10.1007/s00253-019-09706-1
- 21. Herbst, T., Sichelstiel, A., Schär, C., Yadava, K., Bürki, K., Cahenzli, J., et al. (2011). Dysregulation of allergic airway inflammation in the absence of microbial colonization. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 184, 198–205. doi: 10.1164/rccm.201010-1574OC
- 22. Gollwitzer, E. S., Saglani, S., Trompette, A., Yadava, K., Sherburn, R., McCoy, K. D., et al. (2014). Lung microbiota promotes tolerance to allergens in neonates via PD-L1. Nat. Med. 20, 642–647. doi: 10.1038/nm.3568
- 23. Allie, S. R., Bradley, J. E., Mudunuru, U., Schultz, M. D., Graf, B. A., Lund, F. E., et al. (2019). The establishment of resident memory B cells in the lung requires local antigen encounter. Nat. Immunol. 20, 97–108. doi: 10.1038/s41590-018-0260-6
- 24. Cait, A., Hughes, M. R., Antignano, F., Cait, J., Dimitriu, P. A., Maas, K. R., et al. (2018). Microbiome-driven allergic lung inflammation is ameliorated by short-chain fatty acids. Mucosal. Immunol. 11, 785–795. doi: 10.1038/mi.2017.75
- 25. Xiros, C., Shahab, R. L., and Studer, M. H.-P. (2019). A cellulolytic fungal biofilm enhances the consolidated bioconversion of cellulose to short chain fatty acids by the rumen microbiome. Appl. Microbiol. Biotechnol. 103, 3355–3365. doi: 10.1007/s00253-019-09706-1
- 26. Bradley, C. P., Teng, F., Felix, K. M., Sano, T., Naskar, D., Block, K. E., et al. (2017). Segmented filamentous bacteria provoke lung autoimmunity by inducing gut-lung axis Th17 cells expressing dual TCRs. Cell Host Microbe 22, 697–704.e4. doi: 10.1016/j.chom.2017.10.007
- 27. Huang, Y., Mao, K., Chen, X., Sun, M.-A., Kawabe, T., Li, W., et al. (2018). S1P-dependent interorgan trafficking of group 2 innate lymphoid cells supports host defense. Science 359, 114–119. doi: 10.1126/science.aam5809
- 28. Ichinohe, T., Pang, I. K., Kumamoto, Y., Peaper, D. R., Ho, J. H., Murray, T. S., et al. (2011). Microbiota regulates immune defense against respiratory tract influenza a virus infection. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108, 5354–5359. doi: 10.1073/pnas.1019378108
- 29. Gill, H. S., Rutherfurd, K. J., Cross, M. L., and Gopal, P. K. (2001). Enhancement of immunity in the elderly by dietary supplementation with the probiotic Bifidobacterium lactis HN019. Am. J. Clin. Nutr. 74, 833–839. doi: 10.1093/ajcn/74.6.833
- 30. Anand, S., and Mande, S. S. (2018). Diet, microbiota and gut-lung connection. Front. Microbiol. 9:2147. doi: 10.3389/fmicb.2018.02147
- 31. Ruane, D., Brane, L., Reis, B. S., Cheong, C., Poles, J., Do, Y., et al. (2013). Lung dendritic cells induce migration of protective T cells to the gastrointestinal tract. J. Exp. Med. 210, 1871–1888. doi: 10.1084/jem.20122762
- 32. Wang, Z., Bafadhel, M., Haldar, K., Spivak, A., Mayhew, D., Miller, B. E., et al. (2016). Lung microbiome dynamics in COPD exacerbations. Eur. Respir. J. 47, 1082–1092. doi: 10.1183/13993003.01406-2015